ترجمه مقاله توالی یابی به روش پایرو سکیوانسینگ ترانسکریپت روده سوسکچه های خرطوم دار موز - نشریه PLOS

ترجمه مقاله توالی یابی به روش پایرو سکیوانسینگ ترانسکریپت روده سوسکچه های خرطوم دار موز - نشریه PLOS
قیمت خرید این محصول
۲۹,۰۰۰ تومان
دانلود مقاله انگلیسی
عنوان فارسی
توالی یابی به روش پایرو سکیوانسینگ ترانسکریپت روده سوسکچه های خرطوم دار موز حاکی از رونوشت های شبه پروتئاز چندگانه است
عنوان انگلیسی
Pyrosequencing the Midgut Transcriptome of the Banana Weevil Cosmopolites sordidus (Germar) (Coleoptera: Curculionidae) Reveals Multiple Protease-Like Transcripts
صفحات مقاله فارسی
16
صفحات مقاله انگلیسی
16
سال انتشار
2016
نشریه
plos
فرمت مقاله انگلیسی
PDF
فرمت ترجمه مقاله
ورد تایپ شده
نوع مقاله
ISI
نوع نگارش
مقالات پژوهشی (تحقیقاتی)
پایگاه
اسکوپوس
کد محصول
F1148
وضعیت ترجمه عناوین تصاویر و جداول
ترجمه نشده است ☓
وضعیت ترجمه متون داخل تصاویر و جداول
ترجمه نشده است ☓
وضعیت ترجمه منابع داخل متن
به صورت عدد درج شده است ✓
رشته های مرتبط با این مقاله
زیست شناسی و کشاورزی
گرایش های مرتبط با این مقاله
ژنتیک، علوم سلولی و مولکولی، علوم گیاهی، ژنتیک مولکولی و مهندسی ژنتیک
دانشگاه
گروه تولید کشاورزی، دانشگاه کلاداس، مانیزالس، کلمبیا
doi یا شناسه دیجیتال
http://doi.org/10.1371/journal.pone.0151001
فهرست مطالب
چکیده
مقدمه
مواد و روش ها
تشخیص حشره و استخراج DNA روده
آماده سازی کتابخانه cDNA نرمال روده سوردیدوس
توالی یابی و مونتاژ
جست و جوی همولوژی و تفسیر توالی
تحلیل فیلوژنتیکی و ارایش توالی پروتین
RT-PCR نیمه کمی
نتایج
توالی یابی، مونتاژ و تفسیر
طبقه بندی های کارکردی، جست و جو های همولوژی و تحلیل انتولژی ژن
ژن های مربوط به کارکرد های متابولیکی روده و متابولیسم زنوبیوتیکی
همسو سازی پروتین انزیم شبه پروتئاز و تحلیل فیلوژنتیکی
RT-PCR نیمه کمی
بحث
ارسال توالی
اطلاعات مکمل
نمونه چکیده متن اصلی انگلیسی
Abstract

The banana weevil Cosmopolites sordidus is an important and serious insect pest in most banana and plantain-growing areas of the world. In spite of the economic importance of this insect pest very little genomic and transcriptomic information exists for this species. In the present study, we characterized the midgut transcriptome of C. sordidus using massive 454-pyrosequencing. We generated over 590,000 sequencing reads that assembled into 30,840 contigs with more than 400 bp, representing a significant expansion of existing sequences available for this insect pest. Among them, 16,427 contigs contained one or more GO terms. In addition, 15,263 contigs were assigned an EC number. In-depth transcriptome analysis identified genes potentially involved in insecticide resistance, peritrophic membrane biosynthesis, immunity-related function and defense against pathogens, and Bacillus thuringiensis toxins binding proteins as well as multiple enzymes involved with protein digestion. This transcriptome will provide a valuable resource for understanding larval physiology and for identifying novel target sites and management approaches for this important insect pest

نمونه چکیده ترجمه متن فارسی
چکیده
سوسکچه های خرطوم دار موز یک آفت حشره ای مهم در بسیاری از مناطق کشت موز و موز سبز در دنیا است.علی رغم اهمیت اقتصادی این حشره آفت، اطلاعات ژنومی و رونوشتی کمی برای این گونه وجود دارد. در این مطالعه، ما ترانسکریپتوم روده C. sordidus(سوسکچه های خرطوم دار) را با استفاده از پیرو توالی یابی 454 مشخص کردیم.590000 قطعه توالی تولید شد که به 30840 کانتیگ با بیش از 400 bp مونتاژ شد که بیانگر توسعه قابل توجه توالی های موجود برای این آفت است. در این میان 16427 کانتیک شامل یک یا چند GO است. به علاوه،15623 کانتیگ یک عدد EC را داشتند. تحلیل ترانسکریپتوم عمیق ، ژن های دخیل در مقاومت آفت کش به شناسایی بیوسنتز غشای پری تروفیک، عملکرد مربوط به ایمنی و دفاع در برابر پاتوژن ها و پروتین های پیوندی توکسین Bacillus thuringiensis و نیز آنزیم های متعدد درگیر هضم پروتینی کمک کرد. این ترانسکریپتوم یک منبع ارزشمند را برای درک فیزیولوژی لارو و شناسایی سایت های هدف جدید و رویکرد های مدیریتی برای این آفت حشره ای مهم در اختیار گذاشت.

بدون دیدگاه