ترجمه مقاله مسدود کردن پرایمرها برای بهبود تکثیر توالی های کمیاب با PCR در نمونه های مختلط - نشریه BMC

ترجمه مقاله مسدود کردن پرایمرها برای بهبود تکثیر توالی های کمیاب با PCR در نمونه های مختلط - نشریه BMC
قیمت خرید این محصول
۳۳,۰۰۰ تومان
دانلود رایگان نمونه دانلود مقاله انگلیسی
عنوان فارسی
مسدود کردن پرایمرها برای بهبود تکثیر توالی های کمیاب با PCR در نمونه های مختلط - یک بررسی موردی درباره‌ DNA شکار در معده‌ کریل قطب جنوب
عنوان انگلیسی
Blocking primers to enhance PCR amplification of rare sequences in mixed samples – a case study on prey DNA in Antarctic krill stomachs
صفحات مقاله فارسی
18
صفحات مقاله انگلیسی
11
سال انتشار
2008
نشریه
BMC
فرمت مقاله انگلیسی
PDF
فرمت ترجمه مقاله
ورد تایپ شده
رفرنس
دارد
کد محصول
8972
وضعیت ترجمه عناوین تصاویر و جداول
ترجمه شده است
وضعیت ترجمه متون داخل تصاویر و جداول
ترجمه شده است
رشته های مرتبط با این مقاله
زیست شناسی
گرایش های مرتبط با این مقاله
ژنتیک، علوم جانوری و علوم سلولی و مولکولی
مجله
مرزها در جانورشناسی - Frontiers in Zoology
دانشگاه
گروه زیست شناسی، دانشگاه اسلو، نروژ
فهرست مطالب
چکیده
پیشینه
روش‌ها
طراحی پرایمر
نمونه‌برداری و استخراج DNA
آزمون پرایمر‌های ممانعت‌کننده
تکثیر DNA شکار از معده‌ی کریل با PCR
شناسایی کلون‌ها
نتایج
عملکرد پرایمرهای ممانعت‌کننده
بررسی معده‌ی کریل
بحث
نتیجه‌گیری
نمونه چکیده ترجمه متن فارسی
Abstract

Background: Identification of DNA sequence diversity is a powerful means for assessing the species present in environmental samples. The most common molecular strategies for estimating taxonomic composition depend upon PCR with universal primers that amplify an orthologous DNA region from a range of species. The diversity of sequences within a sample that can be detected by universal primers is often compromised by high concentrations of some DNA templates. If the DNA within the sample contains a small number of sequences in relatively high concentrations, then less concentrated sequences are often not amplified because the PCR favours the dominant DNA types. This is a particular problem in molecular diet studies, where predator DNA is often present in great excess of food-derived DNA. Results: We have developed a strategy where a universal PCR simultaneously amplifies DNA from food items present in DNA purified from stomach samples, while the predator's own DNA is blocked from amplification by the addition of a modified predator-specific blocking primer. Three different types of modified primers were tested out; one annealing inhibiting primer overlapping with the 3' end of one of the universal primers, another annealing inhibiting primer also having an internal modification of five dI molecules making it a dual priming oligo, and a third elongation arrest primer located between the two universal primers. All blocking primers were modified with a C3 spacer. In artificial PCR mixtures, annealing inhibiting primers proved to be the most efficient ones and this method reduced predator amplicons to undetectable levels even when predator template was present in 1000 fold excess of the prey template. The prey template then showed strong PCR amplification where none was detectable without the addition of blocking primer. Our method was applied to identifying the winter food of one of the most abundant animals in the world, the Antarctic krill, Euphausia superba. Dietary item DNA was PCR amplified from a range of species in krill stomachs for which we had no prior sequence knowledge. Conclusion: We present a simple, robust and cheap method that is easily adaptable to many situations where a rare DNA template is to be PCR amplified in the presence of a higher concentration template with identical PCR primer binding sites.


بدون دیدگاه